انواع pcr و کاربرد آنها

فهرست انواع PCR

Amplified fragment length polymorphism (AFLP) PCR
Allele-specific PCR
Alu PCR
Assembly PCR
Asymmetric PCR
COLD PCR
Colony PCR
Conventional PCR
Digital PCR (dPCR)
Fast-cycling PCR
High-fidelity PCR
High-Resolution Melt (HRM) PCR
Hot-start PCR
In situ PCR
Intersequence-specific (ISSR) PCR
Inverse PCR
LATE (linear after the exponential) PCR
Ligation-mediated PCR
Long-range PCR
Methylation-specific PCR (MSP)
Miniprimer PCR
Multiplex-PCR
Nanoparticle-Assisted PCR (nanoPCR)
Nested PCR
Overlap extension PCR
Real-Time PCR (quantitative PCR or qPCR)
Repetitive sequence-based PCR
Reverse-Transcriptase (RT-PCR)
Reverse-Transcriptase Real-Time PCR (RT-qPCR)
RNase H-dependent PCR (rhPCR)
Single cell PCR
Single Specific Primer-PCR (SSP-PCR)
Solid phase PCR
Suicide PCR
Thermal asymmetric interlaced PCR (TAIL-PCR)
Touch down (TD) PCR
Variable Number of Tandem Repeats (VNTR) PCR

1.پلی‌مورفیسم طولی قطعات تکثیرشده (AFLP PCR)

این روش یک تکنیک مبتنی بر PCR است که از تکثیر انتخابی بخش خاصی از قطعات DNA بریده‌شده استفاده می‌کند تا الگوهای منحصربه‌فردی (اثر انگشت ژنتیکی) برای ژنوم‌های مورد نظر تولید کند.این تکنیک می‌تواند بدون نیاز به اطلاعات قبلی از توالی ژنومی، به‌سرعت تعداد زیادی قطعه نشانگر ژنتیکی را برای هر موجود زنده‌ای تولید کند.

در این روش، ابتدا DNA ژنومی با استفاده از آنزیم‌های برش‌دهنده (آنزیم‌های محدودکننده) تجزیه می‌شود. سپس به انتهای چسبنده این قطعات، توالی‌هایی موسوم به آداپتور متصل می‌شود. بخشی از این قطعات محدودشده، توسط پرایمرهایی که مکمل توالی آداپتور هستند، برای تکثیر انتخاب می‌شوند.

سپس، توالی‌های تکثیر شده توسط الکتروفورز ژل آگارز در شرایط دناتوره‌کننده از هم جدا شده و قابل مشاهده می‌شوند.

روش AFLP PCR در کاربردهای متنوعی استفاده می‌شود، از جمله:

بررسی تنوع ژنتیکی درون گونه‌ها یا بین گونه‌های نزدیک به هم،
تحلیل روابط تبارشناسی در سطح جمعیتی و الگوهای زیست‌جغرافیایی،
تولید نقشه‌های ژنتیکی،
و تعیین میزان خویشاوندی بین ارقام مختلف گیاهان یا جانوران.